HDP Grup Başkanvekili olduğu dönemde 4 Kasım 2016 tarihinde gözaltına alınarak tutuklanan Baluken, Diyarbakır 8'inci Ağır Ceza Mahkemesi'nde yargılanmış ve 9 yıl 2 ay hapis cezasına çarptırılmıştı.
Baluken, 30 Ocak 2017'de görülen duruşmada hakkında verilen tahliye kararı sonra cezaevinden çıkmıştı. Ancak Diyarbakır Cumhuriyet Başsavcılığı'nın itirazı üzerine Baluken, 22 gün sonra 21 Şubat 2017'de yeniden tutuklanarak cezaevine gönderilmişti.
Hakkındaki cezanın infazını tamamlayan Baluken, 6 yıl 5 ay 1 gün sonra tutuklu bulunduğu Sincan Cezaevi'nden 6 yıl 5 ay 1 gün sonra çıktı.